Microsoft USB Flash Drive Manager realiza copias de respaldo de unidades USB. Las copias de seguridad se hacen desde la pestaña Backup/Restore. Las opciones son dos, realizar la copia de seguridad que crea una imagen del sistema de archivos, y restaurar esta imagen en la memoria USB. Microsoft USB Flash Drive Manager también dispone de un explorador de archivos para transferir ficheros entre el PC y la memoria USB.